마인드워크, AI 기반 면역원성 스크리닝 기술로 항체 개발 효율성 극대화

노형석 기자

작성일 2026-10-23 08:22

마인드워크 홀딩스(MindWalk Holdings Corp.)가 자체 개발한 LensAI™ 면역원성 스크리닝 기술을 통해 89만 개 이상의 항체 서열을 단 4시간 41분 만에 분석하는 데 성공했다고 밝혔다. 이는 5세대 AMD EPYC 프로세서를 탑재한 아마존 EC2 Hpc8a 인스턴스에서 수행되었으며, 기존 인텔 기반 구성 대비 서열당 비용을 최대 43% 절감하는 성과를 거두었다.

마인드워크의 제니퍼 배스 사장 겸 CEO는 “항체 의약품 개발 과정에서 환자의 면역체계가 약물을 공격할 가능성을 초기에 파악하는 것은 매우 중요하다”며, “기존에는 방대한 후보 물질을 모두 스크리닝하는 데 현실적인 어려움이 있었으나, LensAI 기술을 통해 이러한 병목 현상을 해소하고 후보 물질 선정 및 안전성 평가를 가속화할 수 있게 되었다”고 설명했다. 또한, “이번 기술은 비용 효율성을 높여 더 많은 물량을 처리할 수 있게 함으로써, 항체 개발의 새로운 가능성을 열었다”고 덧붙였다.

항체 의약품 개발 시 인체가 치료용 항체를 외부 물질로 인식하여 항약물항체(ADA)가 생성될 경우, 약효 감소, 체내 분포 변화, 안전성 문제 등이 발생할 수 있다. 이러한 위험은 개발 후기에 발견될 경우 막대한 투자 손실로 이어질 수 있으며, 규제 당국은 개발 초기 단계에서의 위험 평가를 더욱 강조하는 추세다.

마인드워크의 LensAI는 HYFT® 기술을 기반으로 인간유사성 점수화, MHC II 결합 예측, 집단 대립유전자 빈도 가중 등 세 가지 요소를 종합적으로 분석하여 면역 위험 점수를 산출한다. 특히, 기존 방식과 달리 한 번 인덱싱한 데이터를 재사용하는 HYFT® 패턴을 통해 비교 작업을 조회(lookup) 방식으로 전환하여 효율성을 극대화했다. 또한, 독립적인 단위로 분할된 연산 파이프라인은 가용한 모든 코어를 활용하도록 설계되어 높은 코어 수를 결과물로 빠르게 전환시킨다.

이번 연구 결과는 마인드워크가 AMD와의 지속적인 기술 협력을 통해 이루어낸 성과를 보여준다. 마인드워크는 AMD Instinct™ GPU와 AMD EPYC 서버 프로세서를 활용한 다양한 프로젝트를 성공적으로 수행해 왔으며, 이번 벤치마크는 이러한 협력의 연장선상에 있다.